W skład Powiatowej Stacji Sanitarno-Epidemiologicznej w Nowym Tomyślu wchodzą:

1) Oddział Ekonomiczny i Administracyjny,

2) Oddział Nadzoru

w skład którego wchodzą:

a) Sekcja Epidemiologii,

b) Sekcja Higieny Żywności i Żywienia,

c) Sekcja Higieny Komunalnej,

d) Stanowisko Pracy do Spraw Higieny Pracy,

e) Stanowisko Pracy do Spraw Higieny Dzieci i Młodzieży,

f) Stanowisko Pracy do Spraw Zapobiegawczego Nadzoru Sanitarnego;

3) Stanowisko Pracy do Spraw Bezpieczeństwa i Higieny Pracy i Ochrony Przeciwpożarowej;

4) Stanowisko Pracy do Spraw Kadr i Szkoleń;

5) Stanowisko Pracy do Spraw Obrony Cywilnej i Spraw Obronnych;

6) Stanowisko Pracy do Spraw Organizacji i Statystyki;

7) Stanowisko Pracy do Spraw Oświaty Zdrowotnej i Promocji Zdrowia;

8) Stanowisko Pracy Głównego Księgowego;

9) Stanowisko Pracy Głównego Specjalisty do Spraw Systemu Jakości;

10) Stanowisko Pracy Radcy Prawnego;

11) Stanowisko Pracy Pełnomocnika do Spraw Ochrony Informacji Niejawnych;

12) Stanowisko Pracy Inspektora Ochrony Danych;

13) Stanowisko Pracy Archiwisty.